Les champignons lignivores dégradent la structure du bois, parfois sans symptôme spectaculaire au début. Des fructifications au collet, une cavité humide, une zone creuse ou une couronne qui dépérit doivent être examinées. Une vieille taille mal réalisée crée aussi des portes d'entrée. Après un étêtage, l'arbre émet des rejets nombreux autour de grosses plaies. Leur croissance paraît vigoureuse, mais leur attache superficielle résiste mal au poids et au vent. Répéter la coupe tous les deux ans entretient ce cycle dangereux sans restaurer l'architecture.
Le diagnostic distingue ce qui peut être conservé de ce qui ne le peut plus. Une réduction progressive et un suivi suffisent parfois. Si le tronc est fortement altéré ou si plusieurs charpentières reposent sur du bois dégradé, le démontage d'arbre est réalisé par morceaux, avec rétention près des constructions. Le dessouchage n'est pas automatique après l'abattage. Le rognage de souche convient lorsqu'il faut remettre le terrain à niveau ou replanter à proximité, tandis qu'une souche sans gêne peut rester comme habitat. Avant toute décision, il faut rechercher la cause: champignon, compactage du sol, blessure racinaire, sécheresse ou coupes passées. Une coupe radicale faite sans diagnostic aggrave souvent le problème qu'elle prétend régler. Le devis doit clairement séparer taille, démontage, évacuation et traitement de la souche.